Lambang organisasi NWDI memiliki makna yang dalam dan luhur, mencerminkan prinsip perjuangan, nilai-nilai keislaman, serta cita-cita untuk keselamatan dan kebahagiaan dunia akhirat.
Setiap unsur pada lambang memiliki makna yang saling melengkapi.
Bulan melambangkan Islam.
Bintang melambangkan Iman dan Taqwa.
Sinar Lima melambangkan Rukun Islam.
Tulisan NWDI melambangkan nama organisasi Nahdlatul Wathan Diniyah Islamiyah.
Garis pinggir keliling warna putih melambangkan Kompak Utuh Bersatu.
Warna gambar putih melambangkan Ikhlas dan Istiqomah.
Warna dasar hijau melambangkan Selamat Bahagia Dunia Akhirat.
Lambang tersebut sama sekali tidak berbeda jauh dari lambang asal organisasi sejak didirikan Al-maghfurulahu Maulana Syaikh TGKHM. Zainuddin Abdul Majid.
Penamaan Nahdlatul Wathan Diniyah Islamiyah mencakup dua aspek: Nahdlatul Wathan sebagai nama organisasi yang didirikan beliau serta NWDI sebagai lembaga pendidikan formal pertama yang beliau dirikan dan sebagai induk seluruh sekolah atau madrasah saat ini.
Logo NW tanpa kotak dan tanpa tulisan NWDI.
Logo NWDI dengan kotak dan tulisan NWDI.
Sebagai tambahan informasi, inilah lambang awal yang dicetuskan pendirinya. Lambang Organisasi Nahdlatul Wathan adalah “Bulan Bintang Bersinar Lima”, dengan warna gambar putih dan warna dasar hijau.